北京崇文中方中医院是国家中医药管理局机关服务局主办的，国家非营利性医保定点中医医院。其前身是国家中医药管理局于1994年初创建的“全国专科疾病北京中医药治疗中心”。到今天为止，北京崇文中方中医医院已经成立29年了。

当年，为了促进我国中医药专科的发展，给广大患者提供高层次、高水平的中医特色服务，国家中医药管理局在全国范围内筛选出一批具诊疗特色、疗效可靠的专科专家进京应诊，并报请北京市卫生局批准，成立了全国专科疾病北京中医药治疗中心。“中心”的成立得到了卫生部等各级领导的大力支持，原卫生部长陈敏章、崔月犁、张文康等皆亲自为“中心”题词：“发挥中医药优势加强专科建设”、“发挥中医优势服务人民健康”。时任国家中医药管理局局长佘靖等多位领导多次莅临中心视察，对中心医疗工作给予了肯定。《人民日报》、《北京日报》、CCTV、BTV等多家媒体对“中心”多位专家曾进行专题报道。十四年来“中心”为数十万名患者解除了病痛，其治疗范围广及海内外，受到患者一致好评。

2008年，为积极落实吴仪副总理在全国卫生工作会议上提出的关于名医、名科、名院的“三名战略”的重要指示精神。从而规范医院管理，拓宽服务范围，进一步发挥“中心”的专业与优势，更好满足广大患者就诊需求，经有关部门批准，成立了北京崇文中方中医医院。医院由北京中医界的院长及一批医院专业管理人员组成管理团队。倡导“崇德、精术、诚信、和谐”的服务理念；以继承、宏扬、发展中医药文化，推广中医适宜技术，以病人为中心，以质量为保证为办院宗旨。医院拥有一支以“享受政府特殊津贴”的专家及在专病专科方面独有建树的知名专家组成的学科带头人队伍，其中有主任医师，副主任医师，主治医师，博士学位，硕士学位等优秀医生。全体医务人员坚守“方博脉真”、“中存仁心。